Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB23Q9ULC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms