Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR35Q9P2L0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR35Q9P2L0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR35Q9P2L0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms