Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.1 ms