Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD2Q9HC29 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD2Q9HC29 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD2Q9HC29 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD2Q9HC29 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD2Q9HC29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms