Protein–RNA interactions for Protein: Q9H322

VCX2, Variable charge X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX2Q9H322 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCX2Q9H322 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCX2Q9H322 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms