Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM3Q9BZL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms