Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25Q9BV90 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms