Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD5Q99717 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms