Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAF11Q99590 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF11Q99590 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF11Q99590 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF11Q99590 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms