Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETDB2Q96T68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SETDB2Q96T68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETDB2Q96T68 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms