Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY1Q96T51 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms