Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCD1Q96RS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms