Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRC1Q96M27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms