Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNBD2Q96M20 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms