Protein–RNA interactions for Protein: Q96IZ5

RBM41, RNA-binding protein 41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM41Q96IZ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM41Q96IZ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM41Q96IZ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM41Q96IZ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms