Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX27Q96GQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 534.4 ms