Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN3Q96D15 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms