Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC9Q8TBE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms