Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL3Q8N8U3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms