Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC82Q8N4S0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms