Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKAP2LQ8IYA6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms