Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD2Q8IXW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms