Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS3Q8IXF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms