Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPA2Q8IWL1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPA2Q8IWL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms