Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRAG1Q86YV5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRAG1Q86YV5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAG1Q86YV5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAG1Q86YV5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms