Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFRP4Q6FHJ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFRP4Q6FHJ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms