Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYSMD4Q5XG99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYSMD4Q5XG99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms