Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms