Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF648Q5T619 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms