Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC183Q5T5S1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC183Q5T5S1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms