Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF19Q5SWL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF19Q5SWL8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF19Q5SWL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF19Q5SWL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEF19Q5SWL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms