Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP47Q5SQN1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms