Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D3Q587I9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms