Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C4orf17Q53FE4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms