Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC38Q502W7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.3 ms