Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB8Q3ZCM7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB8Q3ZCM7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms