Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSGA10IPQ3SY00 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSGA10IPQ3SY00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSGA10IPQ3SY00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSGA10IPQ3SY00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms