Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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NRF1Q16656 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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NRF1Q16656 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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NRF1Q16656 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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NRF1Q16656 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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NRF1Q16656 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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NRF1Q16656 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NRF1Q16656 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms