Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FXNQ16595 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXNQ16595 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXNQ16595 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXNQ16595 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXNQ16595 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXNQ16595 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXNQ16595 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FXNQ16595 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXNQ16595 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXNQ16595 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXNQ16595 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXNQ16595 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXNQ16595 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXNQ16595 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXNQ16595 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXNQ16595 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXNQ16595 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXNQ16595 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXNQ16595 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXNQ16595 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FXNQ16595 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXNQ16595 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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