Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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EXT1Q16394 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXT1Q16394 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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