Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SSX2Q16385 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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