Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8Q15843 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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