Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL19A1Q14993 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL19A1Q14993 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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