Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN1Q14444 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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