Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SHROOM2Q13796 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SHROOM2Q13796 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHROOM2Q13796 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHROOM2Q13796 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms