Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPRL3Q12980 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPRL3Q12980 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPRL3Q12980 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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