Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1T1Q06455 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms