Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms