Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HBBP68871 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HBBP68871 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HBBP68871 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HBBP68871 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HBBP68871 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HBBP68871 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HBBP68871 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HBBP68871 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HBBP68871 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HBBP68871 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms