Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM4P67936 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM4P67936 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM4P67936 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM4P67936 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM4P67936 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM4P67936 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM4P67936 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM4P67936 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM4P67936 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM4P67936 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM4P67936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM4P67936 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM4P67936 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM4P67936 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM4P67936 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM4P67936 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM4P67936 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM4P67936 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM4P67936 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms